#OpenData #DataSharing Datos compartidos en medicina, revisiones sistemáticas y meta-análisis

El post de hoy, podría decirse, es una continuación del post previo.

El NEJM publicó nuevamente una serie de artículos en su sección Perspective [1,2,3,4] sobre datos compartidos en ensayos clínicos; esto aunado al trabajo que me encuentro desarrollando para mi tesis, me llevan a traer el tema de datos compartidos en las revisiones sistemáticas y met-análisis.

En el caso de los ensayos clínicos existen diferentes plataformas para el registro de estos, lo mismo sucede con las revisiones sistemáticas; en la actualidad este registro es principalmente realizado en la plataforma PROSPERO [5] y si los autores lo consideran (y tiene presupuesto) puede publicar un protocolo mucho más detallado en BioMed Central[6], no son las únicas plataformas pero si las más conocidas. Estos espacios para registro y publicación de protocolos contribuyen a evitar duplicidades en el trabajo e incluso facilita el contacto entre autores.

Pero sería de gran utilidad para la ciencia y para los autores si pudiera existir un repositorio con toda la información que se deriva de una revisión y que termina en suplementos (eso si es publicada).

La información que sería interesante que se publicara sería:

• Estrategias de búsqueda usadas
• Número de resultados obtenidos en cada búsqueda, con la fecha de la búsqueda.
• El formulario de extracción de datos (muy relevante para otros análisis y para facilitar la continuidad de las revisiones).

En este escenario, si sería importante contactar a los autores originales para saber si ellos continuarán la revisión o que ellos publiquen la periodicidad con la que llevaran a cabo esto (esto último sería más sencillo).

Si esto se convirtiera en parte del proceso de publicación de revisiones además de facilitar nuevas revisiones, también facilitará la validación de los datos y nuevos análisis a los datos. 

Esto puede ser quizá un poco más sencillo que compartir datos de ensayos clínicos, porque acá no es necesario evitar la identificación de los autores de los estudios incluidos en la revisión, puesto que de hecho este es un aspecto a tener en cuenta en la extracción de datos.


[1]http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp1605260
[2]http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp1607282
[3]http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp1605654
[4]http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp1607342
[5]http://www.crd.york.ac.uk/PROSPERO/
[6]https://systematicreviewsjournal.biomedcentral.com/

#OpenData - #DatosAbiertos, compartir datos de ensayos clínicos

Durante este año en varias ediciones del New England Journal of Medicine (NEJM) se ha hablado de compartir datos; unos de los artículos más controvertidos fue la editorial de Enero en la que se mencionaba que una de las preocupaciones de algunos investigadores era la aparición de investigadores parásitos[1]; no obstante en mayo se publicaron otros artículos mostrando las ventas y preocupaciones de esta iniciativa[2], [3].

Es de anotar que dentro de las ventajas de compartir datos en salud podemos encontrar:

• Mayor aprovechamiento de los datos
• Revisión de los resultados por pares
• Promoción de redes colaborativas de investigadores
• Avance más científico más rápido

Un ejemplo de las posibilidades y ventajas que pueden brindar los datos compartidos se puede observar en el caso del ZIKA [4].

Dentro de las complejidades de los datos compartidos podemos mencionar:

• La participación de los autores que han obtenido los datos originales, en las obras derivadas de estos; esto aunque es una complejidad puede resolverse a través de la mención de los autores o incluso del trabajo colaborativo.
• La curación de los datos
• La plataforma para poner a disposición los datos
• La privacidad de los pacientes
• Los costos de compartir los datos
• La brecha que puede haber en el aprovechamiento de los datos entre países en vías de desarrollo y países desarrollados.

Muchas de estas complejidades fueron mencionadas en [5].

Si bien es cierto que todas estas complejidades tendrán que resolverse, es importante considerar también el formato que se usará para compartir los datos; de hecho, vendría muy bien, como se mencionó en NEJM [5], que se generará un estándar internacional para compartir estos datos, pero dentro de este aspecto es muy importante que se incluyan los tipos de formatos aceptables para compartir los datos y que estos formatos fueran necesariamente abiertos[6]. 

El hecho de que los formatos sean abiertos favorecería las ventajas y el propósito de compartir los datos de los ensayos clínicos; mientras que el uso de formatos cerrados favorecería que los datos fueran aprovechados por quienes dispongan de los medios económicos para poder verlos y procesarlos. 

Es de anotar, que también sería deseable que el acceso a estos datos fuera gratuito, lo cual puede que sea difícil de llevar a la realidad, por los costos que puede tener la plataforma para compartir dichos datos y la curación de los mismos; no obstante, si esto se convierte en un estándar/práctica y es desde el principio parte de los ensayos, los costos podrían ser mucho más reducidos. 

Finalmente, es deseable que la Organización Mundial de la Salud lidere esta iniciativa, teniendo en cuenta los beneficios que esto supone para el avance científico en salud.

[1]http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMe1516564#t=article

[2]http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp1605148?query=health-policy-and-reform#.V1gZl95OhD8.twitter

[3]http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp1605378#t=article

[4]http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp1602278

[5]http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMp1605348#t=article

[6]https://es.wikipedia.org/wiki/Formato_abierto

La democracia participativa y real ya no es una utopía

Todos los días diferentes diarios locales y mundiales ofrecen noticias sobre corrupción en los diferentes niveles tanto públicos como privados; generalmente sean que la corrupción esté en lo público o en lo privado, los recursos que se terminan perdiendo y que no se recuperan, corresponde a recursos que hemos puesto todos como ciudadanos, de un modo u otro.

Pero cada cierto tiempo, tenemos la oportunidad de elegir nuevos gobernante, y se esperaría que las cosas cambiaran, que luego de tantos siglos algo se hubiera aprendido, pero al final parece ser que nada cambia.

En Colombia, una frase de cajón muy usada es: "somos un país sin memoria", pero, ¿acaso el mundo occidental no tiene memoria? (no digo del mundo oriental, porque lo desconozco por completo), si los escándalos de corrupción, pasan por Colombia, Venezuela, Brasil, países de Europa, Estados Unidos, etc.

Quizá además de que no tenemos memoria, lo que nos falta es tener educación en política, la democracia no tiene sentido si los ciudadanos no tienen/tenemos autonomía, y no hay forma de tener autonomía sino tenemos educación de calidad, que nos permita formar nuestro criterio. Claro, hoy en día es mucho más fácil acceder a la educación y aún más sencillo a la información, pero se debe crear una cultura que invite a que la gente se interese más por la política, que al final del día incide en múltiples aspectos de nuestras vidas.

Por lo anterior, considero que la educación básica (léase primaria y secundaria) tiene que abordar esos aspectos, tiene que precisar más en que conozcamos aspectos tanto de la política como de la administración pública, para que como ciudadanos podamos juzgar las propuestas de los candidatos, evaluar si estas son plausibles y vigilar su cumplimiento. Es necesario que aprendamos el poder que tenemos como ciudadanos, que comprendamos que los funcionarios públicos están para servir a los intereses de los ciudadanos y no al empresario o político de turno.

Una ciudadanía más activa y empoderada en esta era de información es cada más posible. En esta era, también será necesario que reflexionemos sobre la necesidad de la democracia representativa; con el avance de la tecnología, cada día es más fácil que los ciudadanos podamos opinar y decidir sobre los temas que nos atañen. Sí, hoy ya es posible que los ciudadanos seamos consultados para aprobar X o Y ley, ya no es necesario que solo unos pocos decidan, hoy todos podemos decidir. 

Por tanto, ya es hora de que esa democracia representativa que hemos tenido históricamente, evolucione y pase a ser una democracia participativa, con ciudadanos autónomos, una verdadera democracia, no el intento de democracia que tenemos hoy. 

Las bacterias acabaran con nosotros...

En una clase de enfermedades transmisibles, se ha mencionado ya en dos ocasiones que, las bacterias estuvieron antes que nosotros y estarán después de nosotros, y concuerdo con dicha afirmación.

Esos organismos, microscópicos y menos complejos que nosotros, han estado aquí durante un largo tiempo y es esa poca complejidad, es una ventaja, que permite que se adapten al medio, rápidamente, eso incluye adaptarse a los antibióticos que usamos cuando intentamos combatirles.

Sir Alexander Fleming, en su conferencia al aceptar el Nobel[1] mencionaba que no era difícil generar bacterias resistentes, a la vez que expresaba su preocupación por el momento en el que los antibióticos fueran fácilmente accesibles en un supermercado; ¡cuanta razón tenia Fleming!.

En el papel, los antibióticos en muchos países, tienen restricciones para su venta y se requiere de fórmula médica para acceder a estos; no obstante, eso dista de la realidad; aunque no conozco muchos países, puedo decir que en los dos que he vivido, no es difícil acceder a los antibióticos, al menos a los de amplio espectro. Esto supone que se pueden presentar cualquiera de la siguientes situaciones con mucha frecuencia: uso innecesario, a dosis inadecuadas y/o por un tiempo inadecuado, todas ellas facilitadoras de resistencia microbiana. 

Pero si en la realidad de los ciudadanos de a pie se facilita el mal uso de los antibióticos, que decir del uso por parte del personal sanitario; donde en muchas ocasiones se envían tratamientos que no se requieren, se permite que el paciente presione por la formulación de estos, y desde donde cuesta mucho educar al paciente para que comprenda que los antibióticos están dirigidos contra un tipo específico de microorganismos: las bacterias.

Sí, los antibióticos no sirven cuando se tienen infecciones por otros microorganismos como hongos, parásitos, o virus.

Las bacterias han aprovechado nuestro mal uso y sus habilidades evolutivas para generar múltiples y complejos mecanismos de resistencia [2].  

Además de la resistencia, tenemos otro problema: la poca rentabilidad que supone crear un nuevo antibiótico, puesto que incluso antes de su comercialización, ya se pudo haber observado resistencia por parte de las bacterias a las cual está dirigido, por lo cual su tiempo de vida útil no parece muy atractivo; del mismo modo estos medicamentos no suelen ser demasiado costosos por lo que el desarrollo de otros que sí lo son, como los medicamentos para el cáncer, puede parecer más atractivo.

Ante esta perspectiva, casi desoladora, pensé ¿entonces las bacterias acabaran con nosotros?.

Creo que no, no acabaran con todos nosotros, pero si continuarán generando mortalidad alrededor del mundo. De hecho, si no se desarrollan técnicas de biología molecular que puedan combatir de manera más efectiva los microorganismos multiresistentes, es posible que en unos 10 años tengamos nuevamente enfermedades infecciones que antes fueron controladas, convirtiéndose en problemas importantes de salud pública.

Es curioso que Fleming advirtiera de los peligros del mal uso de los antibióticos y estemos como estamos, me pregunto ¿el conocimiento para qué?, no debería ser para aplicarlo...

1. http://www.nobelprize.org/nobel_prizes/medicine/laureates/1945/fleming-lecture.pdf

2. http://www.nature.com/nrmicro/journal/v13/n1/full/nrmicro3380.html

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